arXiv cs.LG

月経周期におけるヒト内膜の遺伝子分解と機能解析のための階層ベイズモデル

Hierarchical Bayesian Model for Gene Deconvolution and Functional Analysis in Human Endometrium Across the Menstrual Cycle

http://arxiv.org/abs/2510.27097v1


この記事では、月経周期におけるヒト内膜の遺伝子表現を解析するための階層ベイズモデルを提案しています。一般的な組織RNAシーケンシングでは、細胞の種類特異的なダイナミクスが隠されるため、このモデルを用いて、バルクRNA-seqデータを個々の細胞タイプの表現とその割合に分解します。内膜組織におけるホルモン駆動の細胞組成の変化を考慮し、周期の各フェーズにおける細胞タイプの割合と特異的な遺伝子発現の変化を推測します。結果として、月経の各フェーズ間で上皮、ストローマ、免疫細胞の割合の動的変化が明らかになり、特定の細胞タイプに関連する遺伝子発現の差異も特定されました。また、モデルの堅牢性を検証し、今後の方向性として空間トランスクリプトミクスとの統合を提案しています。