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InertialAR: 慣性フレームを用いた自己回帰型3D分子生成

InertialAR: Autoregressive 3D Molecule Generation with Inertial Frames

http://arxiv.org/abs/2510.27497v1


InertialARは、トランスフォーマーベースの自己回帰モデルを使用して3D分子を生成する新しい手法です。本研究では、分子をSE(3)変換や原子インデックスの順序に対して不変な1Dトークン列にトークン化することが困難であるという2つの課題に取り組んでいます。InertialARは、分子を慣性フレームに合わせてトークン化し、原子を再配置するアプローチを提唱します。また、幾何学的ローテーショナルポジショナルエンコーディングを利用して、注意機構に幾何学的認識を組み込んでいます。実験結果では、InertialARはQM9、GEOM-Drugs、B3LYPの無条件分子生成の評価基準7つで最先端の性能を達成し、制御可能な生成においても優れた成果を示しています。