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Arcバーチャルセルチャレンジ: 入門

Arc Virtual Cell Challenge: A Primer

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Arc Instituteは、バーチャルセルチャレンジを発表しました。この挑戦では、遺伝子のサイレンシングが特定の細胞タイプに与える影響を予測するモデルを訓練することが求められます。このタスクは「コンテキスト一般化」と呼ばれています。主にMLエンジニアを対象にした内容ですが、生物学のバックグラウンドがない人にも参加を促すように設計されています。目標は、CRISPRを使用して遺伝子をサイレンシングした際の細胞への影響を予測するモデルを訓練することです。これにより、実際の実験を行うことなく、数千の薬剤候補をテストできる可能性が示されています。訓練データには約30万の単一細胞RNAシーケンシングプロファイルが含まれており、220,000の細胞から得られたトランスクリプトームデータが提供されます。キーワードは、制御細胞とその動的挙動を利用して、遺伝子的変化を観察することです。